創建は不明だが、倭姫世記という古書によると、崇神天皇から天照大神のご神体である御鏡を「何処へおまつりしたらよいかさがしてきなさい」という命を受けた豐鋤入姫命が、紀伊国奈久佐浜宮から備中国名方浜宮（現在の真備町穴門山神社）へ奉遷し、４年間奉斎したと記されている。
しかし永正年間に戦災にあい、焼失。 地元の郷民は相談して、川上郡高山村（現高梁市）に穴門山神社の行在所を設け、避難した。 その後兵乱が続き再興する時期がなかったが、享保５年庚子３月、再興の命があり、岡田藩主従五位下伊藤播磨守長救が再び真備町高山に社殿を建築し同年９月２４日遷宮を執行した。
-岡山県神社庁HPより-　 [ 詳細 ]

■コメント
山のかなり高いところにあります。車で来る際は、道がとても狭いので注意してください。
国道から少し北へ入ったところに『赤鳥居』がありますが、ここから結構距離はあります。
また、この神社へは総社市新本から（吉備カントリー裏側から）も行けますが、車では途中までしか行けません。
ちなみに高梁市川上町高山にも同名社がありますが、由緒に書いてある通り、戦災にあい一度真備から川上町に遷座し、その後元あった地に再興したためです。